说起ROS1突变的治疗，必须提起肺癌的“钻石突变”——ALK突变。ALK和ROS1的激酶活性区域有70%的相似性，因此许多ALK的抑制剂都能被用做ROS1突变患者的治疗。
对于ROS1突变的转移性非小细胞肺癌，克唑替尼、色瑞替尼都是标准一线疗法。克唑替尼的有效率高达70——80%，中位无进展生存期为19.2个月。但克唑替尼无法通过血脑屏障，对于脑转移患者疗效较差。
色瑞替尼对于ROS1突变的肺癌患者，有效率高达62%，对于此前未接受过克唑替尼治疗的患者，中位无进展生存期为19.3个月，对于曾接受克唑替尼治疗、但疾病持续进展或耐药的患者，中位无进展生存期仍可达到9.3个月。同时，色瑞替尼也可以通过血脑屏障包括使用克唑替尼耐药的患者。
然而，针对ALK阳性患者效果极佳的二代靶向药“阿来替尼”则对ROS1阳性者无效。
如果患者对克唑替尼、色瑞替尼都产生了耐药，美国NCCN指南推荐用三代的ALK抑制剂劳拉替尼继续治疗。劳拉替尼于2020年02月在香港上市，作为强效保底药，适用于ALK阳性和ROS1阳性晚期非小细胞肺癌。
除此之外，还有一种广谱抗肿瘤靶向药—恩曲替尼，对ROS1阳性肺癌患者同样有效。前期研究显示，对于ROS1基因突变的非小细胞肺癌，恩曲替尼的有效率为77%。并且，相比克唑替尼，恩曲替尼也能够通过血脑屏障，对于发生脑转移的患者治疗总缓解率为55.0%。
从药物可及性来说，克唑替尼是目前国内医保唯一已经获批用于ROS1重排的靶向药物。色瑞替尼虽然2018年就在国内上市，同年纳入医保，但国内色瑞替尼医保适应症为ALK阳性转移性非小细胞肺癌。其他的治疗ROS1阳性的靶向药，布加替尼、卡博替尼、恩曲替尼、洛普替尼等，在国内均未上市。
